Το νεότερο, σύγχρονο χωριό της Μαρώνειας, εξαιτίας του φόβου των επιδρομών των πειρατών, χτίστηκε, τον 16ο αιώνα, σε υψόμετρο 250 μέτρα περίπου πάνω από τη θάλασσα. Χαρακτηρίζεται, ως ένας από τους πιο όμορφους, παραδοσιακούς οικισμούς της Θράκης. Τα σπίτια, χτισμένα στις πλαγιές του όρους Ίσμαρος, συστήνουν, γύρω από κάθε ναό, ενορίες, ενώ η αμφιθεατρική τους διάταξη προσφέρει στο καθένα άπλετη θέα στο Αιγαίο πέλαγος, από τη Θάσο έως τη Σαμοθράκη. Επί Οθωμανικής Αυτοκρατορίας, η Μαρώνεια διοικούνταν, από τη γενική συνέλευση των κατοίκων, τους δημογέροντες, την Επιτροπή των Ιερών Ναών και την Εφορεία των Σχολών.
Ο οικισμός της Μαρώνειας με θέα προς τα δυτικά. Στο βάθος η οροσειρά της Ροδόπης.
